Fue fundado en 1996 como tal, aunque bien es cierto que el club ha tenido filial en años atrás, como el Alicante CF por los años 60, el Hércules Atlético desde 1974 o posteriormente bajo las denominaciones de Hércules Promesas, camiseta barça 2023 Mutxamel CF y CD Español de San Vicente respectivamente. Respecto a las nacionalidades de los entrenadores del Hércules, predominan absolutamente los entrenadores españoles, si bien otras 7 nacionalidades diferentes han ocupado el banquillo, como por ejemplo la húngara con tres míticos personajes como Hertzka, Kocsis o Kálmár; o la inglesa de los entrenadores pioneros hasta la fecha documentados, como Finning o mister Harris.